Фамилия Кочарли — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с привычной славянской моделью образования. В отличие от фамилий на -ов, -ин или -ский, суффикс -ли выдаёт тюркское или, шире, восточное происхождение. В тюркских языках, особенно в азербайджанском и турецком, аффикс -lı/-li образует прилагательные со значением принадлежности к чему-либо или обладания чем-либо. Таким образом, основа «кочар» (или «кочар») могла означать род деятельности, место жительства или личное качество.

Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «кочар» — «кочевать», «кочевник». В таком случае Кочарли — это «кочевой», «относящийся к кочевью». В азербайджанской ономастике известен топоним Кочарли (название села или местности), и фамилия могла возникнуть как указание на выходца оттуда: «тот, кто из Кочарли». Это типичная модель для фамилий народов Закавказья и Ближнего Востока, когда родовое имя или прозвище закреплялось за целой семьёй.

Есть и другая версия, менее распространённая, но возможная: связь с армянским словом «кочар» — «козёл» (или с диалектным вариантом). В таком случае фамилия могла быть прозвищем пастуха, упрямого человека или того, кто держал коз. Однако тюркская версия выглядит убедительнее из-за суффикса -ли, который в армянском языке нехарактерен для фамилий (там чаще встречаются -ян, -енц).

В русском контексте фамилия Кочарли — явный пришелец, сохранивший исходное восточное оформление. Её носители — это, скорее всего, потомки выходцев из Азербайджана или соседних регионов, которые переселились в Россию в XIX–XX веках. Фамилия не получила массового распространения, оставаясь редкой и локальной. Встретить её можно преимущественно на юге России, в Ставропольском крае, Краснодарском крае или в среде азербайджанской диаспоры.