Фамилия Кочкарина образована от мужской формы Кочкарин, которая, в свою очередь, восходит к прозвищу Кочкарь. Слово «кочкарь» в русских говорах неоднозначно, но наиболее вероятное его значение связано с ремеслом или родом занятий. В северных и сибирских диалектах «кочкарить» означало «кочевать, бродяжничать», а «кочкарь» — бродячий торговец или человек, ведущий неоседлый образ жизни. Однако есть и другая, более приземлённая версия: «кочкарь» могло быть прозвищем человека, жившего на болотистой, кочковатой местности, или того, кто постоянно спотыкался о кочки.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Кочкарин — «сын Кочкаря» или «из семьи Кочкаря». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -арь (ср. Пономарёв, Бондарев). Мужская форма Кочкарин фиксируется в документах XVII века: в переписных книгах Вятской земли встречаются крестьяне с этим прозвищем, что говорит о бытовании фамилии в северных регионах России.

Интересно, что фамилия Кочкарина (женская форма) встречается реже, чем мужская, и распространена преимущественно в Пермском крае и Кировской области — на территориях, где исторически была сильна вятская колонизация. Это косвенно подтверждает версию о прозвище, связанном с кочевым промыслом: Вятка и Пермь в XVI–XVII веках были зонами активного переселения и торгового обмена.

Однокоренные фамилии — Кочкин, Кочков, Кочкарев — имеют схожую основу, но различаются по суффиксам. Кочкарин выделяется именно моделью на -арь, которая чаще давала фамилии ремесленников или людей с яркой характеристикой. Если Кочкин или Кочков прямо указывают на связь с кочкой (неровностью земли), то Кочкарин несёт оттенок действия или профессии.

Таким образом, в основе фамилии Кочкарина лежит либо прозвище бродячего торговца, либо характеристика человека, жившего на болотистой почве. Точное значение зависит от местности, где фамилия возникла, но в любом случае это прозвище было дано не случайно — оно отражало заметную черту первого носителя.