Фамилия Кодакова — женская форма от Кодаков, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Модель на -ов (в мужском варианте) указывает на типичное русское происхождение: так образовывали фамилии от имени или прозвища отца. В основе лежит прозвище Кодак или Кодака.

Самое прямое объяснение корня — географическое. Кодак (или Койдак) — это название знаменитой крепости на Днепре, построенной в XVII веке поляками и впоследствии захваченной запорожскими казаками. Прозвище Кодак могли дать человеку, который жил в той местности, участвовал в обороне крепости или просто пришёл оттуда. В таком случае фамилия Кодаков — типичное «местническое» прозвище, превращённое в родовое имя. Это самая правдоподобная версия, потому что крепость Кодак была хорошо известна в истории, а её название попало в документы и народную память.

Менее очевидная, но допустимая версия отсылает к тюркским языкам. В казахском и татарском «кодак» имеет значение «жеребёнок» (обычно по второму году). В русских говорах это слово могло закрепиться как прозвище для резвого, молодого или невысокого человека. Однако эта гипотеза слабее: прозвища от детёнышей животных в русской среде встречаются, но обычно в формах «Жеребцов», «Теляков», а не через тюркский корень. Для фамилии Кодаков днепровская крепость — более сильная и документированная привязка.

В написании фамилии есть одна особенность: ударение. В фамилии Кодаков оно падает на второй слог (Кодаков), а не на первый. Это отличает её от слова «кодак» (кодак), если бы оно существовало в русском языке как самостоятельное. Такое смещение ударения характерно для многих русских фамилий, образованных от топонимов.

Сословно фамилия Кодаковых не привязана к дворянству — это скорее крестьянская или казачья фамилия, распространённая в южнорусских и украинских землях. Носители фамилии могли быть потомками запорожских казаков или выходцами из Екатеринославской, Херсонской губерний. Встречается она и сейчас, но не слишком часто, что делает каждую ветвь рода уникальной в своём происхождении.