Фамилия Коканова — женская форма от Коканов, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Типичный русский патроним -ов/-ев указывает на происхождение от отца: Коканов — «сын Кокана». В основе лежит прозвище или некалендарное имя Кокан, которое могло возникнуть от глагола «кокать» — бить, ударять, или от существительного «кокан» в диалектном значении «шишка, нарост». В некоторых говорах «кокан» — это ещё и детская игрушка, бабка для игры в городки. То есть прозвище могло принадлежать человеку драчливому, либо тому, кто мастерил такие игрушки, либо обладателю заметной шишки или родинки.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с тюркскими корнями. В казахском, татарском и башкирском языках «кокан» (күкән) — это «пуповина» или «пупок», а также «детёныш, малыш». Такое прозвище могли дать младшему или позднему ребёнку в семье. Учитывая, что фамилия Коканов встречается в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — регионах активного смешения славянского и тюркского населения, — эта этимология вполне правдоподобна для части носителей.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Коканов — редкий пример, где суффикс -ов присоединён к основе на -ан, что создаёт двойной акцент: на корне и на суффиксе. Сравните с однокоренными фамилиями Кокин, Кокорев, Кокшаров — у них другая морфология и разные источники. Кокин, например, скорее всего, от прозвища Кока (удар, стук), а Кокорев — от «кокора» (кривое дерево, пень).

Социально фамилия не элитарная: в дворянских родословных книгах Кокановы не значатся. Скорее всего, предки были крестьянами, ремесленниками или казаками. В документах XVII–XVIII веков фамилия встречается среди посадских людей и однодворцев южных уездов России. Географически ядро фамилии — Воронежская, Тамбовская, Саратовская губернии, а также Оренбуржье.

Итог: фамилия Коканова — это либо прозвище по действию (драчун, мастер игры), либо по внешности (шишка), либо тюркское именование младшего ребёнка. Точная версия зависит от региона проживания конкретной семьи.