Фамилия Колбунова почти наверняка образована от прозвища Колбун. В русских говорах «колбун» — это не просто человек с изъяном, а конкретный диалектизм, означающий «косой» или «кривой на один глаз». Слово родственно «колоброд», «колбать» (качать, ковылять) и указывало на хромоту или кривизну. Вероятнее всего, прозвище давали человеку с заметным дефектом зрения или походки, причём не в оскорбительном, а в описательном смысле — как и тысячи других «очных» фамилий (Кривошеев, Косоглазов).

Суффикс -ов- в основе Колбунов- типичен для русских фамилий, образованных от мужских прозвищ на твёрдый согласный. Форма Колбунова — женская, принадлежащая женщине или потомку по женской линии. Мужской вариант — Колбунов.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий вроде Колобков (от «колобок»), Колбуновы встречаются реже и имеют более узкую географию. По данным современных телефонных справочников и баз, носители фамилии сосредоточены в центральных и южных областях России — в Воронежской, Липецкой, Ростовской областях. Это совпадает с зоной распространения южнорусских говоров, где слово «колбун» и было в ходу.

Версия о происхождении от тюркского «кол» (рука) и «бун» (рана) маловероятна: русская словообразовательная модель с суффиксом -ун (как в «говорун», «плясун») естественнее объясняет основу. Если бы фамилия была тюркской по корню, она скорее сохранила бы форму вроде Колбанов или Калбунов.

В документах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется среди дворянских родов — это однозначно крестьянское или посадское прозвище, перешедшее в наследственную фамилию после отмены крепостного права. Предки современных Колбуновых, скорее всего, были ремесленниками или землепашцами, получившими фамилию по уличному прозвищу.

Написание с двумя «н» («Колбуннова») ошибочно: в фамилии один суффикс -ов-, а удвоение не предусмотрено ни исторической, ни современной нормой.