Фамилия Колкпаев — нечастый случай, когда корень слова почти наверняка ведёт не в тюркские языки, а в финно-угорские, а точнее — в коми-пермяцкую или коми-зырянскую среду. Основа «колк» в диалектах коми означает «колокол» или «колокольчик» (звукоподражательное, от «колкöдны» — звенеть). Суффикс -паев — это искажённое коми «пöв» (сын, потомок), которое в русской записи превратилось в «пай» или «паев». Поэтому Колкпаев буквально переводится как «сын колокола» или «колокольный мастер».

Вероятнее всего, прозвище Колк (Колко) дали человеку, который лил колокола, торговал ими или же просто обладал звонким, громким голосом — в северных говорах «колком» могли называть крикливого, бойкого человека. Фамилия образована по той же модели, что и, скажем, фамилии Колпаков или Колокольников, но с местным, пермским суффиксом принадлежности. Если бы носитель был татарином или башкиром, мы бы ждали окончания -ов или -ев без «п» (Колкаев, Колков), а здесь явно сохранился автохтонный формант «пай/паев», характерный для фамилий коми-пермяков и удмуртов.

Географически фамилия привязана к северо-востоку европейской России: Пермский край, Республика Коми, Кировская область. В документах XVIII–XIX веков такой тип фамилий часто встречался среди государственных черносошных крестьян, которые не знали крепостного права и имели большую свободу передвижения. Сословного барьера у Колкпаевых, скорее всего, не было — это фамилия вольных землепашцев или ремесленников, осевших на Урале.

В написании фамилии возможен вариант Колкопаев (с соединительной гласной «о»), но в современном виде она закрепилась без неё — под влиянием упрощённого произношения. Спорных версий происхождения почти нет: тюркская гипотеза (от «кол» — рука и «кап» — мешок) маловероятна, так как не объясняет суффикса «паев» и не находит подтверждения в антропонимии тюркских народов. Фамилия редкая, её носители — живое свидетельство того, как язык коми, смешавшись с русской административной традицией, создал уникальную фамильную форму.