Фамилия Комагина — женская форма фамилии Комагин, которая образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от основы с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Комагин буквально значит «сын Комáги» или «человек из рода Комáги». В центре внимания здесь не имя, а прозвище или мирское имя Комáга.

Что могло значить слово «комага»? В диалектах русского языка, особенно северных и сибирских, «комага» — это разновидность лодки-долблёнки, выдолбленной из цельного ствола дерева. Такие лодки использовали для рыбной ловли и передвижения по рекам. Прозвище Комага могли дать человеку, который делал такие лодки, или тому, кто постоянно ходил на комаге — рыбаку, перевозчику. В этом случае фамилия указывает на ремесло или род занятий предка.

Есть и другая версия, менее распространённая, но лингвистически возможная. В некоторых говорах «комага» — производное от «ком» (комок, кусок) или от глагола «комать» (мять, месить). Тогда прозвище могло относиться к человеку плотного телосложения или к тому, кто занимался грубой работой, например, мял глину или тесто. Однако связь с лодкой выглядит более конкретной и правдоподобной: фамилии, образованные от названий предметов быта или орудий труда, встречаются чаще, чем от абстрактных качеств.

Фамилия Комагин (и её женская форма) — редкая. Она не связана с известными дворянскими родами и, скорее всего, имеет крестьянское или посадское происхождение из северных регионов России, где была распространена лодка-комага. Встречается она и сегодня, но преимущественно на севере европейской части страны и в Сибири — там, где реки и озёра были главными дорогами.