Фамилия Комальцева — женская форма, а её основа — мужская фамилия Комальцев, которая образовалась не от имени, а от прозвища. В русских фамилиях суффикс -ев/-ов обычно указывает на принадлежность («чей сын?»), но в случае с Комальцевым мы имеем редкий случай: основа здесь — слово «комаль» или «комальц», которое на слух воспринимается как искажённое.

Скорее всего, в основе лежит диалектное слово «комель» — толстый конец бревна, нижняя часть дерева, а также пень, чурбан. От «комель» образовали прозвище Комель — так могли назвать коренастого, приземистого человека или, в переносном смысле, упрямого, «дубового». Далее через уменьшительную форму «Комалёк» (с чередованием е/а в народной речи) возникла фамилия Комальцев — то есть потомок Комальца. Чередование «е» и «а» в корне типично для южнорусских и украинских говоров: «комель» могло звучать как «комаль».

Вторая, менее вероятная версия — связь с тюркским словом «комал» (песок, песчаный) или с кавказским топонимом. Но для русской фамилии, бытующей в центральных областях, это малоправдоподобно: фамилия Комальцевы встречается в документах Воронежской, Курской и Тамбовской губерний — как раз в зоне распространения южновеликорусского аканья, где «комаль» — естественное произношение слова «комель».

Суффикс -цев указывает на то, что прозвище было усечено до формы на -ец (Комаль → Комальец → Комальцев). Такая модель редка: обычно фамилии на -цев образуются от названий профессий (кузнец → Кузнецов), но здесь — от прозвища. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был известен в своей среде как Комалёк или Комаль, и его дети получили фамилию по отцу.

Таким образом, Комальцевы — потомки человека, которого прозвали за крепкое телосложение или упрямство Комалем (от «комель»). Фамилия недворянская, крестьянская или однодворческая, с отчётливой географической привязкой к Черноземью.