Фамилия Кондобарова — женская форма мужской фамилии Кондобаров. Её основа — прозвище или нецерковное имя Кондобар, которое, скорее всего, составное. Первая часть, «Кондо-», может восходить к диалектному «конды» (крепкий, здоровый, коренастый) или к тюркскому «конды» (сосед, пришелец). Вторая часть, «-бар», вероятно, означает «барин» или «боярин» (ср. «баров» — от «барин»). Таким образом, Кондобар — это «крепкий барин» или «пришлый господин». Это прозвище могли дать зажиточному крестьянину либо человеку, который держался с достоинством, «по-барски».

Суффикс «-ов» в фамилии Кондобаров указывает на её типичное русское происхождение: такие фамилии чаще всего получали крестьяне и мещане в XVI–XIX веках. В отличие от дворянских фамилий на «-ский», эта модель была массовой и означала «сын Кондобара» или «из семьи Кондобара».

Фамилия редкая. Её географическое ядро, по всей видимости, связано с южнорусскими или поволжскими областями, где встречаются фамилии с такими же составными прозвищами (например, Дубасов, Кособоков). Встречается также вариант Кондобарова с ударением на втором или третьем слоге — это зависит от местного говора.

Имя-основа Кондобар не фиксируется в святцах и не имеет отношения к христианским именам. Это чисто бытовое прозвище, которое закрепилось за родом и перешло в фамилию. В документах XVII–XVIII веков, если они найдутся, носителей такой фамилии стоит искать среди однодворцев или государственных крестьян, а не среди дворян.

Сравните с однокоренными фамилиями: Кондырев (от «кондырь» — козырек, задира), Кондюков (от тюркского имени). Кондобаров стоит особняком — он явно сложен из двух корней, что делает его редким исключением в русской фамильной системе.