Фамилия Кондратов образована от канонического имени Кондрат, которое пришло на Русь вместе с христианством. В основе имени лежит латинское слово «quadratus» — «четырехугольный». В переносном смысле это могло означать «широкоплечий», «крепкого сложения». Так что предок-родоначальник Кондратовых, скорее всего, получил имя по стати — или его так назвали при крещении в честь святого с тем же именем.

По модели образования фамилия типична для русской традиции: суффикс -ов указывает на принадлежность. Кондратов буквально значит «сын Кондрата», «потомок Кондрата». Такая схема — имя отца плюс -ов — покрывает большинство русских фамилий, и Кондратов здесь не исключение. В документах XVI–XVII веков имя Кондрат встречается часто: его носили и крестьяне, и посадские люди, и казаки. Поэтому географически фамилия разошлась широко — от северных земель до южных окраин.

У фамилии есть однокоренные «родственники»: Кондратьев (с тем же корнем, но с другим суффиксом), Кондрашов, Кондратенко. Если Кондратов встречается чаще в центральных и северных областях России, то украинский вариант с суффиксом -енко — Кондратенко — привязан к югу. Это не разные фамилии по смыслу, а разные способы сказать одно и то же: «чей-то сын».

Любопытная деталь: в некоторых говорах имя Кондрат звучало как Кондрот, и фамилия могла писаться через «о» — Кондротов. Такие варианты встречаются в старых переписных книгах, но не прижились. Современная орфография закрепила форму Кондратов, и именно она считается нормативной.