Фамилия Кондратюков — это отчество второй ступени, или «внучество». Если разобрать её по составу, становится ясно: Кондратюков — это сын Кондратюка и внук Кондрата. Такая цепочка встречается реже, чем прямое отчество на -ов, и указывает на то, что фамилия сформировалась не в центральной России, а на западе.

Корень здесь — мужское крестильное имя Кондратий. В переводе с латыни оно означает «четырехугольный» или «широкоплечий». На славянской почве книжная форма Кодрат со временем превратилась в более привычное Кондрат, а затем и в Кондратий. Именно от народной, краткой формы Кондрат и пошла вся цепочка.

Ключевая деталь — суффикс -юк. В русской ономастике он считается характерным признаком украинской и белорусской традиции. В этих землях отчества на -юк (как и на -ук, -чук) были обычным делом: они означали «маленький» или «сын такого-то». Фамилия Кондратюк, в свою очередь, очень распространена на Украине. А вот форма Кондратюков — это уже русифицированный вариант, который возник, когда носитель украинской фамилии попал в среду, где фамилии оформляли по великорусской модели: к основе «Кондратюк» добавили стандартный русский суффикс -ов.

Таким образом, предок носителя фамилии Кондратюков — человек по имени Кондрат, живший, скорее всего, на территории современной Украины или Белоруссии. Его сына в народе звали Кондратюком, а вот внук, перебравшись в великорусские губернии или при оформлении документов, получил фамилию с двойным патронимическим суффиксом — Кондратюков.