Фамилия Кондратовец образована от имени Кондрат — народной формы крестильного имени Кондратий (в церковной традиции Кодрат, от латинского quadratus — «квадратный», то есть «широкоплечий», «коренастый»). В украинской, белорусской и польской ономастике суффикс -овец указывает на происхождение от человека по имени Кондрат: буквально «сын или потомок Кондрата». Это типичная модель для западнорусских и южнорусских земель, где фамилии на -овец встречаются чаще, чем в северных областях.

Интересно, что в отличие от массовых фамилий на -ов (Кондратов), форма с -овец сохраняет более узкую региональную привязку. Скорее всего, фамилия закрепилась на территории современной Беларуси, западной Украины или в пограничных районах России — в тех местах, где в XVI–XVII веках активно использовался суффикс -ец для обозначения родства. В переписных книгах и реестрах казаков Войска Запорожского встречаются прозвища вроде Кондратенко, Кондратович, а Кондратовец — более редкий вариант, который мог возникнуть как уточняющее прозвище для выходца из конкретного рода.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от названия населённого пункта вроде Кондратово или Кондратовцы. В таком случае фамилия указывала бы на переселенца из этой местности. Однако в исторических документах такие топонимы фиксируются редко, и основа на личное имя выглядит убедительнее.

В среде крестьян и мещан фамилии на -овец часто давали по отцу, но без привязки к сословию — это мог быть как свободный земледелец, так и ремесленник. Носители фамилии Кондратовец, вероятно, происходят из семей, где имя Кондрат передавалось через поколение, пока не закрепилось в родовом прозвище. В современных телефонных справочниках фамилия встречается в основном на западе России, в Беларуси и в восточных областях Украины — что подтверждает её региональный характер.