Фамилия Кондручин — редкий пример отчества, образованного не напрямую от крестильного имени, а от его разговорной, «домашней» формы с помощью суффикса -ин. Основа здесь — Кондруча, уменьшительное от имени Кондрат (церковное Кондратий). В быту имя Кондратий дробилось на десятки производных: Кондраша, Кондруша, Кондрюша, а форма Кондруча — одна из наименее частых, что и объясняет редкость фамилии.

Суффикс -ин в данном случае указывает на принадлежность: «чей сын?» — Кондручин, то есть сын Кондручи. Такая модель типична для фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а, -я. Поскольку в основе лежит каноническое имя, фамилия не несёт прозвищного смысла — она прямо отсылает к предку по имени Кондратий, в быту звавшемуся Кондручей.

Географически фамилия Кондручин тяготеет к южнорусским и украинским областям, где форма Кондрат и его производные были особенно распространены. Встречается она в основном в Курской, Белгородской, Воронежской областях и на востоке Украины. В северных и центральных регионах России чаще встречаются фамилии Кондратьев, Кондрашин, Кондрушин — с другими суффиксами и огласовками.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) фамилия не выделяется отдельно, но её механизм образования полностью укладывается в описанную модель: от краткой формы имени + -ин. Спорных версий у фамилии нет — корень прозрачен, а суффикс однозначен.

С социальной точки зрения, Кондручин — типичная крестьянская или мещанская фамилия. Она не встречается среди дворянских родов, не фиксируется в старых боярских списках. Её носители — потомки людей, которых в документах XVII–XIX веков записывали как «Кондрат Иванов сын» или просто «Кондруча», а затем закрепили фамилию по отцу.