Фамилия Кондрулина — женская форма, а мужская, Кондрулин, образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы прозвища или имени с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность, буквально «чей?» — сын или потомок человека, которого звали Кондруля.

Корень здесь — Кондр-, который почти наверняка восходит к крестильному имени Кондратий (через народную форму Кондрат). В русских говорах имена часто укорачивали и «размягчали» суффиксами: Кондрат → Кондруля. Суффикс -ул(я) — уменьшительно-ласкательный, как в «Ванюля» от Иван, «Петруля» от Пётр. Значит, Кондруля — это ласковое, домашнее прозвище человека по имени Кондрат или Кондратий.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным словом «кондра» или «кондрый». В некоторых говорах «кондрый» значило «крепкий, здоровый», а в рязанских и тамбовских — «скупой, прижимистый». Если прозвище Кондруля дали не по имени, то по характеру: либо крепыш, либо скряга. Однако первая версия, от имени, встречается гораздо чаще: фамилии на -улин/-улина почти всегда «именные» (например, Ванюлин, Петрулин).

Географически фамилия Кондрулин не привязана к одной узкой области, но чаще встречается в центральных и южных регионах России — там, где имя Кондрат было особенно популярно среди крестьян и мещан. В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян Кондратовых, Кондрашкиных и, реже, Кондрулиных — все они из одного гнезда, от имени Кондратий.

Таким образом, предок современных Кондрулиных — скорее всего, человек по имени Кондрат, которого в семье или в деревне звали ласково Кондруля. Фамилия недворянская, типично крестьянская или посадская; её носители — потомки простых людей, чьё прозвище закрепилось в документах при переписях.