Фамилия Кондрусь звучит необычно для русского уха, и это первый ключ к её происхождению. Её основа — Кондр- — это вариант имени Кондрат или Кондратий, которое восходит к латинскому имени Конрад (Conradus), означающему «смелый советник» или «отважный в решениях». На русской почве имя Кондратий приобрело народные формы — Кондрат, а в украинском и белорусском языках — Кондрат, Кондрусь. Именно эту уменьшительно-ласкательную форму и взяли за основу фамилии.

Суффикс -усь указывает на юго-западное, скорее всего украинское или белорусское, происхождение фамилии. В этих регионах фамилии на -усь, -ук, -юк — распространённое явление. Кондрусь буквально означает «маленький Кондрат» или «сын Кондрата». Это типичная модель для фамилий, образованных от имени отца: сначала прозвище Кондрусь закрепилось за одним человеком, а затем перешло к его потомкам.

Встречается фамилия в основном на западе Украины, в Беларуси и в смежных областях России (Брянская, Смоленская). Носители фамилии — потомки крестьян или казаков, потому что в этих краях фамилии на -усь редко встречались у дворянства. Интересно, что в польском языке есть фамилия Kondrus, которая могла возникнуть параллельно — от того же корня, но с другим суффиксом. В русской среде фамилию могли записать как Кондрусь, так и Кондрус — из-за того, что мягкий знак в документах иногда опускали.

Словообразовательная модель проста: основа (Кондр-) + суффикс (-усь). Никаких дополнительных суффиксов вроде -ов или -ин здесь нет, что делает фамилию «чистой» — она сохранила форму прямого прозвища. Это редкий случай, когда фамилия не обросла типичными русскими окончаниями, а осталась в том виде, в каком её дали в XVII–XVIII веках.