Фамилия Кондя — редкий случай, когда прозвище могло возникнуть из‑за гастрономических пристрастий. В её основе лежит украинское слово «конде» — так называли рисовую кашу с фруктами и вареньем, блюдо, хорошо знакомое в славянской кухне. Готовили его в глиняных горшках, томили в печи, и лакомство это было не повседневным, а скорее праздничным. Человек, получивший прозвище Кондя, скорее всего, выделялся особой любовью к этому кушанью — либо часто его заказывал, либо умел вкусно приготовить.

По образованию фамилия относится к типу бессуффиксных, то есть прозвище перешло в фамилию без добавления типичных русских окончаний -ов, -ев или -ин. Такая модель характерна для украинской и южнорусской ономастики, где фамилии нередко оставляют в форме чистого прозвища. Встречается она и у других народов, но в случае с Кондя украинский корень — самый прямой и логичный.

Слово «конде» не стоит путать с тюркскими заимствованиями: здесь нет связи с конём или конницей. Версия о происхождении от имени Кондратий (через сокращение Кондя) тоже возможна, но менее убедительна — для такого сокращения обычно используют форму Кондрат или Кондраша, а Кондя звучит как отдельное прозвище, а не как уменьшительное от полного имени.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским областям, где рисовые каши с фруктами были частью местной кухни. Встречается она нечасто, и это делает её особенно заметной для тех, кто ищет корни своей семьи.