Фамилия Кондякова образована от прозвища Кондяк, которое восходит к украинскому нарицательному «кондак», что в переводе на русский язык означает «краткая церковная песнь». В некоторых говорах «кондак» – «хитрый, злоречивый». В таком случае можно предположить, что прозвище Кондяк указывает на черты характера его обладателя. Согласно другой, менее правдоподобной версии, прозвище Кондяк имеет тюркское происхождение и образовано от слова qondaq, что в переводе на русский язык означает «овечья шерсть, в которую кладут новорожденного ребенка на несколько дней, после чего перекладывают в колыбель». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кондяк, со временем получил фамилию Кондякова.