Фамилия Кондыбко звучит необычно для русского уха, и это подсказка: перед нами яркий пример украинской модели фамилии. Суффикс -ко — один из самых характерных маркеров украинской ономастики (наряду с -енко, -ук, -чук). В данном случае он выполняет уменьшительную или принадлежную функцию, то есть Кондыбко — это буквально «маленький Кондыба» или «сын/потомок Кондыбы». Основа же фамилии — прозвище Кондыба, которое и нужно разобрать.

Слово «кондыба» в украинских говорах имеет несколько значений, и все они далеки от книжной речи. Чаще всего так называли неуклюжего, неловкого человека, увальня. В некоторых диалектах «кондыбать» означало «ковылять», «идти вразвалку». Второй, более редкий оттенок — «упрямец», «человек, который стоит на своём, как бык». Таким образом, родоначальник Кондыбок получил прозвище либо за манеру ходьбы, либо за характер — тяжёлый и неповоротливый или, наоборот, упёртый.

С точки зрения географии, фамилия Кондыбко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине. В России она встречается редко и, как правило, в тех регионах, куда в XIX–XX веках переселялись украинские крестьяне (Кубань, юг Сибири). Социальный состав носителей был преимущественно крестьянским или казачьим: прозвища с «бытовой» семантикой редко давали духовенству или шляхте.

Любопытно, что фамилия почти не имеет вариантов написания — это не Кондыбко, а именно Кондыбко. Встречающаяся изредка форма Кондыба — это, скорее всего, не искажение, а исходное прозвище, от которого и пошла фамилия. Сравните с другими украинскими фамилиями на ту же основу: Кондыбенко, Кондыбайло. Все они образованы от одного корня, но разными суффиксами, что говорит о том, что прозвище было достаточно распространённым в определённой местности.