Фамилия Конхины образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: с помощью патронимического суффикса -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность: «чей?» — «Конхин», то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Конха. Такие именования, построенные по схеме «основа + -ин», широко представлены у восточных, западных и южных славян, что делает фамилию Конхин самобытным памятником славянской культуры.

Основа фамилии — слово «конха». В русских говорах так называли небольшой ковш, черпак или деревянную чашу. Прозвище Конха могли дать человеку, который делал такие ковши (бондарю или резчику по дереву), либо тому, кто имел привычку пить из большой посудины. Не исключён и вариант, что слово закрепилось за человеком небольшого роста или с округлыми чертами лица — по ассоциации с формой ковша.

Менее вероятна, но возможна связь с греческим словом «конха» (раковина, створка), которое через церковную архитектуру или книжную культуру могло попасть в прозвище. Однако географическая привязка фамилии — преимущественно северные и центральные губернии России (Вологодская, Архангельская, Костромская) — говорит в пользу исконно славянского, бытового корня.

Фамилия Конхин передавалась из поколения в поколение и сохранила память о прозвище предка. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Конхин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.