Фамилия Коногоров образована от прозвища Коногор, которое ведет свое начало от аналогичного нарицательного. Коногорами в старину называли шахтеров. Кроме того, не исключено, что в основу фамилии Коногоров лег топоним Коногоры — в России существует несколько деревень с таким названием. Можно предположить, что предок обладателя фамилии Коногоров был уроженцем одной из них. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Коногор, со временем получил фамилию Коногоров.