Фамилия Кононенков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Кононенков послужило церковное имя Конон. Имя Конон имеет греческое происхождение и переводится как «трудящийся, трудолюбивый». Скорее всего, основатель рода Кононенковых был уважаемым человеком. Сама по себе фамилия Кононенков является отчеством второго порядка: Кононенков - сын Кононенко, внук Конона. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Конон, со временем получил фамилию Кононенков. О точном месте и времени возникновения фамилии Кононенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кононенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.