Фамилия Конопаткина образована от прозвища Конопатка, которое, скорее всего, восходит к слову «конопатка» (от глагола «конопатить») означает процесс закупоривания щелей между брёвнами избы или досками лодки пенькой, паклей, хлопком, мхом. Таким образом, прозвище Конопатка мог получить человек, профессионально занимающийся конопаткой судов, или же тот, кто был вынужден часто ремонтировать свою избу. Также прозвище Конопатка мог получить конопатый, то есть веснушчатый человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Конопатка, со временем получил фамилию Конопаткина.