Фамилия Коношонкина — редкий пример того, как прозвище, связанное с местом, превратилось в фамилию через цепочку уменьшительно-ласкательных суффиксов. В её основе лежит название населённого пункта Коноша, а точнее — его производное. Коноша — посёлок в Архангельской области, стоящий на реке с тем же названием. Гидроним, скорее всего, финно-угорского происхождения: в карельском и вепсском языках есть слова, означающие «заяц» или «глухарь». Таким образом, предок носительницы этой фамилии мог быть выходцем из Коноши или её окрестностей.

Словообразовательная цепочка необычна. Сначала от названия места образовали прозвище Коношонок — так могли называть человека, который перебрался из Коноши в другую местность, сохранив память о малой родине. Суффикс -онок в северных говорах часто указывал на молодость или принадлежность: «коношонок» — буквально «маленький коношанин», «сын коношанина». Затем от этого прозвища через стандартный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»), возникла фамилия Коношонкин. Форма Коношонкина — женский вариант, образованный по тому же правилу.

География фамилии подтверждает эту версию. Основная масса носителей сосредоточена на Русском Севере — в Архангельской, Вологодской областях, а также в Кировской области, куда в XIX веке переселялись северяне. Встречается фамилия и в других регионах, но локально, что типично для прозвищ, привязанных к конкретному топониму.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает разнообразие моделей: Коношин (прямая связь с названием), Коношев (по отцу), Коношанский (по месту жительства). Коношонкин стоит особняком из-за двойного суффикса — это редкий случай, когда прозвище человека, а не его отчество, стало основой для фамилии. В словарях фамилия не зафиксирована, но её прозрачная этимология и региональная привязка не оставляют сомнений: предки носительницы были крестьянами или мещанами из северных губерний, а сама фамилия — живое свидетельство переселения «из Коноши».