Скорее всего, она связана с названием города Конотоп (Сумская область). Он расположен на реке Езучь (приток реки Сейм). Поселение Новоселицы было основано украинскими казаками в начале XVII века. Первое упоминание о городе датируется 1635, в 1642 здесь была построена крепость и названа по речке Конотопка. В 1659 под городом и его окрестностях состоялась Конотопская битва между татарско-казацким войском гетмана Выговского, нарушившего решение Переяславской рады 1654 года, и московским войском А. Трубецкого.В 1782 Конотоп получил статус города. Вероятно, предок обладателя фамилии долгое время жил в этом городе, за что и получил прозвище Конотоп.