Фамилия Коныратов — одна из тех, где корень не бросается в глаза, а суффикс заставляет задуматься о происхождении. В русской ономастике она стоит особняком, и её разбор — хороший пример того, как географический и этнический контекст важнее, чем прямой перевод.

Главная загадка — основа «Конырат». В русском языке нет корня «коныр» с бытовым значением, которое напрямую породило бы прозвище. Однако фамилия явно образована по русской модели: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Коныратов — сын или потомок Конырата. Само же имя или прозвище Конырат — это, скорее всего, тюркское имя. У казахов, башкир, каракалпаков и других тюркских народов известно родоплеменное название «Конырат» (варианты — Кунграт, Конграт). Это название одного из крупных древних племён. В таком случае фамилия Коныратов — русифицированная форма, которую получил человек, принадлежавший к этому роду или носивший родовое имя.

Вторая, менее вероятная, версия отсылает к казахскому слову «қоңыр» (коныр) — бурый, смуглый, а также «родной, близкий». С добавлением аффикса -ат могло образоваться прозвище Конырат — «смугловатый», «домосед». Но племенная гипотеза выглядит убедительнее, потому что у тюркских народов имена по названию рода — распространённая практика (сравните с фамилиями Найманов, Кипчаков, Аргынов).

Географически фамилия Коныратов тяготеет к регионам с тюркским населением: Казахстан, Оренбургская, Астраханская области, Башкортостан. В центральных русских областях она редка. Форма на -ов, а не на -ин, подсказывает, что в основе — имя на согласный (Конырат), а не на -а или -я.

Таким образом, предки Коныратовых, вероятнее всего, были выходцами из тюркской среды, получившими фамилию по родоплеменному имени. Это не ремесленная и не сословная фамилия, а этнонимическая — она фиксирует родовую память.