Фамилия Копненкова — редкий пример отчества второго порядка, то есть «внучьего» имени. Она образована не напрямую от прозвища, а через промежуточную ступень: сначала от прозвища Копня появилась фамилия Копненко (сын Копни), а уже от неё — Копненков (сын Копненко и внук Копни). Суффикс -енко в основе выдаёт украинские или белорусские корни: именно в этих землях была распространена модель фамилий на -енко, обозначавшая потомка.

Что стояло за прозвищем Копня — вопрос с несколькими ответами, и ни один не отбрасываем. Самая прямая версия связана с глаголом «копать» и словом «копань» (выкопанный колодец, яма). Копнёй могли прозвать землекопа или колодезного мастера — человека, который рыл колодцы. Вторая линия ведёт к слову «копна» — большому стогу сена или снопу. В южных и центральных говорах «копна» и есть стог, так что прозвище мог получить косарь или крестьянин, занятый уборкой урожая. Третья версия — от глагола «копить»: Копня в этом случае означал бережливого, запасливого хозяина. Все три гипотезы имеют под собой почву, и выбрать одну без дополнительных сведений о конкретной семье невозможно.

Интересно, что фамилия Копненкова встречается редко и почти не рассеяна по России широко. Это говорит о локальном происхождении — вероятно, из одного села или небольшого региона, где прозвище Копня было в ходу. В отличие от массовых фамилий на -ов, эта сохраняет следы личного, почти домашнего именования, которое сперва закрепилось за одним человеком, а потом перешло по цепочке «дед — отец — внук» в современную форму.