Фамилия Корнюков — отчество второго порядка: Корнюков — сын Корнюка — внук Корня. Она произошла от прозвища Корень, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «часть любого растения».Скорее всего, в основу этой фамилии положено переносное значение этого слова: «упрямый, суровый», либо «скупой». Можно предположить, что такая фамилия указывала на черты характера ее основателя.