Фамилия Коротоякский — один из тех случаев, когда географическое название говорит о происхождении почти безошибочно. Её основа — топоним Коротояк. Это старинный город (ныне село) в Воронежской области, основанный в середине XVII века как крепость на южных рубежах Русского царства. Житель Коротояка или выходец оттуда получал прозвание «коротоякский», которое со временем закрепилось за потомками в виде фамилии.

Суффикс -ский в этой фамилии — типичный для «географических» фамилий дворянского или служилого происхождения. В русской ономастике фамилии на -ский чаще всего указывали на владение землёй или место рождения. Однако для Коротоякского связь с местом не обязательно означает дворянство: Коротояк был крепостью, где жили служилые люди, стрельцы, казаки и посадские. Поэтому предок носителя фамилии мог быть как мелкопоместным дворянином, имевшим поместье в уезде, так и простым горожанином, которого записали по месту жительства.

Сам топоним Коротояк, по наиболее распространённой версии, происходит от тюркского «кара таяк» — «чёрный посох» или «чёрная палка». Это могло быть название речки или урочища, а затем и крепости. Встречается и народная этимология, связывающая название с «коротким яком» (яком называли овраг или балку), но лингвисты считают тюркское происхождение более убедительным.

В написании фамилии возможна путаница с двойным «к» — Коротояккский. Это ошибка: в исходном топониме одна «к», поэтому и в фамилии пишется одна. Встречается также вариант Коротояцкий — с заменой «к» на «ц» под влиянием южнорусского произношения, но правильным с точки зрения исторической нормы считается именно Коротоякский.

Фамилия редкая. Её география по большей части привязана к Воронежской области и соседним регионам, откуда происходили переселенцы из Коротоякского уезда. В дореволюционных метрических книгах она встречается у мещан и крестьян, что подтверждает: аристократический суффикс -ский здесь не признак знатности, а просто указание на родину предка.