Фамилия Косаненко образована по продуктивной восточнославянской модели с суффиксом -енко. Этот суффикс исторически формировал фамилии в украинской, реже белорусской среде, обозначая «сына» или «потомка» человека, чьё имя или прозвище легло в основу. В случае Косаненко основа — Косан. Это либо усеченная форма крестильного имени, либо прозвище.

Самая вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Косан, которое восходит к глаголу «косить» или прилагательному «косой». Прозвище Косой в древнерусской традиции давали человеку с дефектом зрения (косоглазие), кривому, либо тому, кто ходил вкось, не прямо. Суффикс -ан мог придавать оттенок ласкательности или, наоборот, указывать на обладателя яркого признака: Косан — «тот, кто косит» или «косоглазый». Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «косан» — так в некоторых говорах называли человека с кривыми, неровными ногами.

Вторая гипотеза — происхождение от неканонического имени Косан, которое могло быть производным от канонического имени Косма (Кузьма) через народную форму Косаня. В этом случае фамилия означает «потомок Косана», то есть Кузьмы. Однако такая версия менее убедительна, так как от имени Кузьма чаще образовывали фамилии с суффиксами -енко напрямую (Кузьменко), а форма Косан для него нехарактерна.

Географически фамилия Косаненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к южным регионам России, куда переселялись украинские крестьяне. Встречается она реже, чем типовые фамилии вроде Коваленко или Шевченко, что говорит о локальном бытовании прозвища-основы. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству — именно в этих средах суффикс -енко был основным маркером семейного имени.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Косанов, Косан, Косань) показывает, что Косаненко — более поздняя форма, закрепившаяся в письменных источниках не ранее XVII–XVIII веков, когда фамилии на -енко стали массово фиксироваться в реестрах Войска Запорожского и метрических книгах. Таким образом, если вы носите фамилию Косаненко, ваш предок почти наверняка был украинцем или выходцем с юга России, а его прозвище указывало на внешнюю особенность — скорее всего, на косоглазие или особую походку.