Фамилия Костякин — один из тех случаев, где суффикс подсказывает больше, чем корень. Модель образования здесь нестандартная: в русских фамилиях чаще встречается суффикс -ин (от основ на -а, -я: Костин, Костяев) или -ов (от основ на согласный: Костюков). А вот -якин — редкий вариант, который указывает на прозвище, а не на прямое отчество от крестильного имени. Скорее всего, в основе лежит не имя Константин (хоть оно и дало уменьшительные формы Костя, Костяка), а прозвище Костяка, которое могло означать либо «костлявый, худой человек», либо, что вероятнее, «упрямый, несговорчивый» — в говорах костякой называли человека с крепким, жестким характером, того, кто «костью стоит».

Суффикс -як в русских прозвищах часто придавал оттенок свойства или качества: бродяга — бродяка, зевака, гуляка. Костяка — тот, кто «костяной» по натуре. От такого прозвища и пошла фамилия: Костякин — сын Костяки. Если бы фамилия образовалась напрямую от имени, мы бы ждали форму Костин или, в редком случае, Костяков. А -якин — это маркер прозвищного происхождения, и таких фамилий в русском языке единицы (сравните с Бледнякин, Сухорякин).

В географическом плане фамилия Костякин встречается нечасто, но прослеживается в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях. Там, где говор сохранял архаичные суффиксы, а прозвища были описательными. Сословно предки Костякиных, скорее всего, относились к крестьянам или посадским людям — фамилия не дворянская, не книжная, а бытовая, возникшая в среде, где прозвище давали по внешности или нраву, а не по отцу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Костяев, Костянов, Костюков — все они идут от разных форм имени Константин, и только Костякин стоит особняком, отсылая к прозвищу. Так что носитель фамилии может с уверенностью сказать: его предок не просто был «Костиным сыном», а носил меткое прозвище, которое говорило о характере — костистый, крепкий, несгибаемый человек.