Фамилия Костынян звучит как типичная армянская, и это верное предположение. Её основа — личное имя или прозвище Костыня, а суффикс -ян указывает на принадлежность к роду, потомка. В армянской ономастике формант -ян (ранее -янц) выполняет ту же роль, что русские -ов или -ин: «из дома такого-то», «сын такого-то». Таким образом, Костынян — это «потомок Костыни».

Что скрывается за именем Костыня? Здесь возможны два пути. Первый — это уменьшительная форма от крестильного имени Константин (от лат. constans — «стойкий, постоянный»). В русской и армянской среде имя Константин давало множество производных: Костя, Костыня, Костыль. Второй вариант — прозвище, связанное со словом «кость». Костыней могли назвать человека худощавого, высокого или, напротив, костистого и крепкого. Слово «костыня» в старых говорах также означало клюку, посох, что могло указывать на хромоту или на пожилого человека, опирающегося на палку.

Географически фамилия тяготеет к западу исторической Армении и к армянской диаспоре, особенно к регионам, где были сильны традиции прозвищ. В дореволюционных записях фамилия встречается среди армян Тифлисской и Эриванской губерний. Сословно носители могли быть и крестьянами, и ремесленниками — армянские фамилии на -ян не дают прямой подсказки о знатности, в отличие от русских дворянских суффиксов.

Есть и редкая версия, что фамилия могла возникнуть независимо у русских, но в форме Костынин. Если же перед нами именно Костынян, то почти наверняка это армянская модель. Сравните с однокоренными Костанян, Костанов — все они восходят к одному корню, но с разными суффиксами. В случае Костынян любопытен суффикс -ын- в основе: он встречается реже, чем -ан-, и может указывать на диалектное произношение или на конкретное прозвище, а не на имя.