Фамилия Котия — редкий случай в русском ономастиконе, где основа не славянская, а грузинская или абхазская. В отличие от привычных русских фамилий на -ов или -ин, здесь мы видим окончание -ия, которое типично для грузинских фамилий (ср. Гамсахурдия, Берия, Данелия). В грузинском языке суффикс -иа часто указывает на принадлежность к роду или местности, а сама основа Кот- восходит к уменьшительной форме имени Константин (Котэ) или к слову «коти» — «кот» в некоторых диалектах. Однако в Грузии фамилия Котия встречается в основном в западных регионах, например в Мегрелии, где распространены фамилии на -ия.

Если же рассматривать фамилию в русском контексте, то она могла возникнуть как искусственная или канцелярская запись. В XIX веке при переписях и паспортизации нерусских народов империи фамилии часто искажали или адаптировали на слух. Котия могла появиться у выходцев с Кавказа, осевших в центральной России, или у греков Приазовья (у них тоже есть фамилии на -ия). Но в чисто русской среде такая фамилия — скорее исключение, чем правило.

С точки зрения словообразования, суффикс -ия здесь не русский, а заимствованный. В русском языке эта модель не продуктивна, поэтому фамилия однозначно указывает на иноязычное происхождение предков. Вероятнее всего, родоначальник носителей фамилии Котия был грузином или абхазом, а сама фамилия передалась без изменений при переходе в русскоязычную среду.

География бытования фамилии сегодня — в основном юг России, Краснодарский край, Ростовская область, а также Москва и Санкт-Петербург за счёт миграций. Встречается она редко, что делает её ярким маркером родовой истории, уходящей корнями в кавказский регион.