Фамилия Котлунина — женская форма, а мужская, Котлунин, образована по типичной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Котлунин значит «сын Котлуны» или «человек из семьи Котлуны». Сама основа Котлуна — это, скорее всего, прозвище, производное от слова «котёл».

В русских говорах «котлуном» или «котляной» могли называть человека, связанного с изготовлением или ремонтом котлов — бондаря, медника, котельщика. Но есть и более конкретная версия: в ряде регионов «котлуном» называли того, кто варит пиво, брагу или смолу, то есть занимается варкой в большом котле. Это ремесленное прозвище, которое закрепилось за родом занятий.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где «котлу» означает «счастливый», «благополучный». Однако фамилия с таким корнем встречается преимущественно в русской среде, и словообразовательная модель с суффиксом -ун (Котлун) типична для русских прозвищ, образованных от глаголов или названий предметов. Поэтому ремесленная версия выглядит убедительнее.

Географически фамилия Котлунин и её женская форма Котлунина распространены в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. Там, где были развиты кустарные промыслы, связанные с металлом и варкой, прозвище Котлуна могло быть нередким.

В целом, Котлунины — потомки, скорее всего, мастерового человека, который работал с котлами, варил пиво или смолу. Фамилия сохранила память о конкретном, живом ремесле, а не об абстрактном качестве.