Фамилия Котомина — один из тех случаев, где прозвище предка спустя века превратилось в фамилию, сохранив прямую связь с бытовой деталью. В основе лежит слово «котома» — так в старину называли путевую суму, укладку или плетёнку. Котомки чаще плели из лыка или бересты, реже шили из кожи или сукна. Прозвище Котома могли дать человеку, который постоянно ходил с такой сумой: страннику, путнику, идущему на богомолье. Со временем от этого прозвища и образовалась фамилия.

Обратите внимание на суффикс «-ин». В русской ономастике он указывает на принадлежность: «чей?» — «Котомин», то есть сын или потомок Котомы. Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а: ср. Головина, Бородина, Котомина. Фамилия закрепилась в мужском варианте (Котомин) и в женском (Котомина), но исторически женская форма — это указание на принадлежность к роду.

Интересно, что слово «котома» — не общеславянское, а скорее севернорусское и диалектное. В говорах Архангельской, Вологодской, Вятской губерний «котома» означала именно заплечный мешок или короб. Поэтому географически фамилия Котомина чаще всего встречается в регионах Русского Севера и Поволжья. Это не случайно: именно там странничество и отходничество были особенно распространены.

Однокоренные фамилии — Котомкин, Котомов — встречаются реже, но все они восходят к тому же прозвищу. В отличие от них, Котомина не связана с кошками или с фамилией Котов — это совершенно разные корни, хоть и звучат похоже.