Фамилия Которин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Самое вероятное объяснение — она образована от прозвища или нецерковного имени Которя. В русских говорах слово «который» имело значение «спорщик, сварливый человек», а глагол «коториться» означал «ссориться, браниться, упрямиться». Таким образом, Которя — это человек с неуживчивым характером, любитель пререкаться. Модель типична для русских фамилий: прозвище на -я (Которя) плюс патронимический суффикс -ин, то есть «сын Которы».

Менее убедительна версия, связывающая фамилию с географическим названием. Теоретически можно предположить основу «котор» в значении «изгиб реки» или «омут» (ср. «котловина»), но для фамилии Которин такая привязка не подкреплена ни документальными источниками, ни массовостью в конкретном регионе. Если бы фамилия была топонимической, скорее всего, она бы встречалась чаще и имела бы вариант Которинский.

Суффикс -ин указывает на древнюю модель образования фамилий в северных и центральных областях России, где -ин присоединяли к основам на -а/-я. Это косвенно говорит о том, что предок носителя фамилии жил в зоне распространения этой модели — возможно, в Новгородской, Вологодской или Архангельской губерниях. Фамилия не принадлежала дворянству: в исторических списках служилых людей и помещиков Которины не значатся. Скорее всего, это фамилия крестьянская или посадская, возникшая в XV–XVII веках.

В современной России фамилия встречается единично, что подтверждает её локальное происхождение. Если вы ищете своих предков, стоит обратить внимание на северные области — там вероятность найти ранние записи выше.