Фамилия Котур — редкий случай, когда основа и суффикс слились в одно слово без типовых фамильных окончаний. В ней нет привычных -ов, -ин или -ский. Перед нами так называемая «застывшая» форма прозвища: человек получил прозвище Котур, и оно перешло в фамилию без изменений. Такие фамилии в русской традиции встречаются реже, чем патронимические, и обычно указывают либо на нерусское происхождение рода, либо на позднее оформление фамилии в крестьянской среде.

Значение слова «котур» неочевидно. В большинстве русских говоров такого слова нет. Наиболее вероятная версия — диалектное или заимствованное прозвище. В украинском и белорусском языках «котур» могло означать «кот» (уменьшительно-ласкательное) или же относиться к человеку с кошачьими повадками — вкрадчивому, хитрому, ленивому. Однако есть и другая гипотеза: в польском языке «kocur» — это кот-самец, а в чешском «kocour» — тоже кот. Фамилия могла прийти с западнославянских территорий вместе с переселенцами или через польское влияние.

Менее распространённая, но не лишённая оснований версия связывает «котур» с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «котур» — «проказа», «чесотка», «парша». Такое прозвище могли дать человеку с кожным заболеванием или, в переносном смысле, — неопрятному, запущенному. В пользу этой версии говорит то, что на юге России и в Поволжье, где активно шли контакты с тюркскими народами, фамилии с похожей основой встречаются.

Географически фамилия Котур наиболее плотно представлена в западных областях России — Брянской, Смоленской, а также на Украине. Это указывает скорее на славянское, чем на тюркское происхождение. Встречается она и у белорусов. Сословного барьера у неё не было: Котурами могли быть и крестьяне, и мещане, и казаки. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия фиксируется без изменений, что подтверждает её прозвищное происхождение.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Котов, Котенков, Котин — Котур стоит особняком. Котов — от имени или прозвища Кот, и это типичная патронимическая модель. Котур же образован не от «кот», а от самостоятельного прозвища, которое могло звучать как Котур. Разница в суффиксе и окончании принципиальна: она говорит о другом способе номинации, более прямом и архаичном.