Фамилия Ковенко звучит как типичная украинская, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -енко указывает на патроним — «маленький», «сын» или «потомок» человека, чьё имя или прозвище легло в основу. В украинской ономастике это самая массовая модель, которая закрепилась в XVI–XVII веках.

Основа Ков- может происходить от нескольких корней. Самый прямой вариант — от прозвища Ков, которое восходит к глаголу «ковать». В славянской традиции Ковом или Ковалём называли кузнеца. Кузнечное ремесло было повсеместным, а фамилии от него — одними из самых частых (Коваль, Ковалёв, Коваленко). Ковенко в этом ряду — редкая форма: не Коваленко, а именно Ковенко, где корень укорочен, а суффикс тот же.

Вторая версия — от уменьшительной формы личного имени. В старых польских и украинских документах встречается имя Кова (как вариант от Яков, через польское Jakub — Kuba, Kuboń, либо от Константин в форме Костя, Котька). Но имя Кова — спорное и редкое, поэтому кузнечное происхождение надёжнее.

Третья, менее вероятная гипотеза — от географического названия. В Беларуси есть деревня Ковенка (Гродненская область), а в Польше — Ковно (историческое название Каунаса). В таком случае Ковенко мог получить человек, переехавший оттуда. Однако для украинской модели -енко это нетипично: обычно так образовывали фамилии от прозвищ, а не от названий мест.

С точки зрения географии, Ковенко — южнорусская и украинская фамилия. По данным современных подсчётов, она встречается в Черкасской, Полтавской и Сумской областях, а также в Краснодарском крае России, куда переселялись казаки. Сословно носители — скорее всего, крестьяне или казаки, потому что суффикс -енко в XVII–XVIII веках был распространён именно в этих слоях, а не среди дворянства.

Таким образом, предки носителя фамилии Ковенко с высокой вероятностью занимались кузнечным делом или получили прозвище от односельчан по этой профессии. Фамилия не редкая, но и не массовая — в отличие от Коваленко или Ковалёва, она сохранила более архаичную и короткую форму основы.