Основой фамилии Ковылин послужило мирское имя Ковыль. Фамилия Ковылин восходит к названию степной травы ковыль. Основой же для фамилии послужило нецерковное имя Ковыль. Давая младенцу такие имена, как, например, Волк, Белка, Соловей, Ковыль, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Существует также гипотеза, по которой в основе фамилии лежит прозвище Ковыль, образованное от глагола «ковылять». Тогда, так могли прозвать медлительного, либо хромого человека.