Фамилия Койдюк — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по частям и привязать к географии. В основе лежит корень «койд-», а суффикс «-юк» сразу указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках суффикс «-юк» (как и «-чук», «-ак») часто образовывал фамилии от личных имён, прозвищ или названий профессий, обозначая «сына» или «потомка» носителя исходного слова.

Что же такое «койд»? Самая правдоподобная версия — это вариант прозвища от диалектного слова «койда», которое в некоторых говорах означало «беспокойный, суетливый человек» или, напротив, «неповоротливый, увалень». Исходное слово могло иметь звукоподражательную природу. Менее вероятно, но допустимо, что фамилия связана с топонимом: на территории современной Украины и Польши встречаются небольшие селения с корнем «Койд-» (например, Койды). В таком случае Койдюк — это «выходец из Койды».

С точки зрения словообразовательной модели, Койдюк стоит в одном ряду с фамилиями вроде Бойдюк (от «бойкий» или имени Бойко), Гайдюк (от «гайда» — движение) или Ходюк (от «ход»). Все они образованы по одному принципу: основа глагольного или именного прозвища плюс суффикс, обозначающий принадлежность. Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или казацким — такие фамилии редко встречались у шляхты, которая предпочитала более «благородные» окончания на «-ский».

Споров вокруг корня немного. Иногда пытаются связать «Койдюк» с тюркским «кой» (овца), но это натяжка: суффикс «-юк» почти не встречается в тюркских фамилиях, а украинская модель образования здесь очевидна. Можно уверенно говорить, что фамилия — восточнославянская, распространённая в западных областях Украины и в южной Беларуси. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались в реестрах казацких полков, но конкретного известного носителя с такой фамилией, оставившего след в истории, пока не выявлено. Фамилия осталась локальной, что делает её особенно ценной для семейной генеалогии.