Фамилия Койшев — один из тех случаев, когда на первый взгляд прозрачная основа оказывается не такой однозначной. На слух она кажется тюркской, и это верное направление. Скорее всего, в её основе лежит тюркское имя Койш, которое можно разобрать как «кой» (овца, баран) и аффикс принадлежности или уменьшительности. В кочевых обществах скотоводческие имена — не редкость, они могли указывать на род занятий или быть пожеланием богатства (много отар). Однако есть и другая версия: в казахском и башкирском языках слово «койшы» означает «пастух» (буквально «овечий пастух»). Тогда Койшев — это фамилия, образованная от прозвища по профессии, по той же модели, что и Чабанов (от «чабан»).

Суффикс -ев указывает на русскую модель оформления фамилии, типичную для народов, вошедших в состав Российской империи: к тюркской основе просто добавили русский патронимический суффикс. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крещёным или просто записанным по-русски тюркоязычным человеком (казахом, башкиром, татарином, ногайцем). Географически фамилия тяготеет к Оренбуржью, Башкортостану, Казахстану — регионам, где веками жили скотоводы.

Встречается и более редкая, славянская версия, которую не стоит сбрасывать со счетов. В русских говорах «койша» — диалектное название койки, кровати, иногда так называли человека, который любит поспать. Но эта гипотеза слабее: во-первых, тюркское происхождение подтверждается массовостью фамилии в Урало-Поволжье, во-вторых, суффикс -ев в сочетании с основой на -ш для чисто русского прозвища нетипичен (обычно было бы Койкин или Койков).

Социальный контекст простой: Койшевы — это потомки не знати, а простых пастухов или владельцев скота. Фамилия не имеет дворянских корней, не встречается в старинных боярских списках. Она из тех, что несут в себе память о повседневном труде, а не о военных походах или княжеских родах.