Фамилия Койшина — женская форма, а мужская, Койшин, встречается редко. С первого взгляда она кажется типичной для тюркских языков: основа «койши» и русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Койшин, то есть «сын Койши»). Но что скрывается за этим прозвищем? Тут есть как минимум две версии, и обе ведут в кочевой мир.

Первая и самая прямая: «койши» — это казахское или киргизское слово, образованное от «кой» (овца) с суффиксом профессии -шы. Койши — пастух овец, чабан. В степи такое занятие было обычным, но прозвище могло закрепиться за человеком, который славился своим стадом или, наоборот, пас чужих овец. Фамилия, таким образом, указывает на род занятий предка. Вторая версия, менее очевидная: «кой» в некоторых тюркских диалектах имеет значение «песня» или «мелодия». Тогда койши — это певец, сказитель, исполнитель кюев. В казахской культуре слово «кюйши» означает именно музыканта-инструменталиста, но фонетически «койши» могло быть вариантом или самостоятельным прозвищем для человека с особым голосом.

Географически фамилия Койшина встречается в основном на юге Западной Сибири, в Омской и Новосибирской областях, а также в Казахстане. Это указывает на то, что носители фамилии — потомки сибирских казахов или татар, которые в XIX–XX веках перешли на оседлый образ жизни и получили русские фамилии по отцовскому прозвищу. Суффикс -ин, а не -ов, здесь закономерен: в тюркских именах и прозвищах, оканчивающихся на -а, -я, -и, русская администрация часто использовала именно эту модель (сравни: Алтынбаев, но Койшин — от Койша, где -а отпало).

Других версий, например, от славянского корня, у фамилии нет. Она однозначно тюркская, и её разговорная форма без уменьшительных суффиксов (Койша, а не Койшик) говорит о том, что прозвище было дано взрослому человеку, а не ребёнку.