Фамилия Козаногин — редкая и на первый взгляд странная. Она звучит почти как прозвище, и это ощущение не обманывает: скорее всего, перед нами именно прозвищная фамилия, образованная от сочетания слов «коза» и «нога».

Разбираем словообразовательную модель. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Козаногин. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ или усечённых форм имён. Основа здесь — цельное прозвище Козанога.

Что могло означать такое прозвище? Первая и самая очевидная версия — внешность. Козаногой в народе могли назвать человека с кривыми, тонкими или косолапыми ногами, напоминающими козлиные. Вторая версия — походка или манера движения: прыгучая, быстрая, неуклюжая, как у козы. Третья, менее вероятная, но возможная — ремесленная: пастух коз или человек, который пасёт коз, но тогда скорее ждали бы форму Козопас или Козопасов.

Версия с прозвищем, данным по внешнему признаку, наиболее правдоподобна. В русской ономастике масса примеров фамилий, построенных по такой же модели: Кривоногов, Сухоногов, Длинноногих. Все они, как и Козаногин, описывают конкретную примету человека.

Географически фамилия крайне редкая. Она не встречается в крупных исторических справочниках и словарях (Унбегауна, Никонова, Веселовского), что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в одном или нескольких сёлах центральной России или Поволжья, где прозвище закрепилось за конкретным родом и не распространилось широко.

В современном написании фамилия сохраняет древнюю прозвищную основу. Её носители, вероятно, потомки одного человека по прозвищу Козанога, который жил несколько веков назад. Других версий — от тюркских или финно-угорских корней — нет, фамилия чисто русская по словообразованию и лексике.