Фамилия Кожин — одна из тех, что прямо указывают на занятие предка. В её основе лежит прозвище Кожа, которое давали человеку, работавшему с кожей: он мог выделывать сыромять, мять кожи или торговать готовыми изделиями. Модель образования простая: к прозвищу добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, и получилось «чей?» — Кожин, то есть сын или потомок Кожи.

Прозвище это древнее. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского упоминаются Федор Тимофеевич Кожа Замыцкий и Макарий Кожин, основатель Калязина монастыря. Там же встречаются и родственные именования: крестьянин Кожеедов Фома и крестьянин Кожурин Григорий — все они из одного смыслового гнезда, связанного с кожей и её обработкой.

Однако у фамилии Кожин есть и другая, дворянская ветвь, которая выводит своё начало не из ремесленной среды, а из военной истории. Согласно родословному преданию, род Кожиных происходит от выходца из Германии Юрия Бахты-Франца, который был послом литовского князя Витовта к московскому князю Василию Дмитриевичу. Его сын, Василий Ананиевич, получил прозвище Кожа за то, что во время преследования Дмитрия Шемяки убил под ним коня и вырезал из него кусок кожи. Эта легенда — типичный пример того, как фамилия, звучащая по-простому, обрастала героической биографией.

Дворянские роды Кожиных записаны в VI часть родословных книг нескольких губерний: Тверской, Ярославской, Воронежской, а также Новгородской и Рязанской. Герб Кожиных внесён в I часть Общего гербовника дворянских родов. Он разделён на четыре части: в первой — натянутый лук и палаш, под ними лоскут кожи; во второй и третьей — по каменной стене; в четвёртой — золотой лев на задних лапах. Щит увенчан дворянским шлемом и короной, а над шлемом между орлиными крыльями повторяются те же символы — лук, палаш, лоскут кожи и каменная стена. Намёт золотой с красной подкладкой.

Среди известных носителей фамилии — советский дирижёр Валентин Васильевич Кожин и картограф Никита Кожин. Но основная масса Кожиных, скорее всего, происходит не от знатных воинов, а от простых ремесленников-кожевников: прозвище Кожа было распространено в среде мастеровых людей, и фамилия закрепилась за их потомками по всей России.