Фамилия Кожурин образована от прозвища или мирского имени Кожура. В древнерусском языке «кожура» — это кожура, шелуха, то есть внешняя оболочка плода, корка. Такое прозвище мог получить человек с грубой, огрубевшей кожей, либо, в переносном смысле, кто-то замкнутый, «закрытый» от окружающих, словно в кожуре. Возможна и профессиональная версия: кожурой называли содранную кору или шкуру, так что прозвище могло закрепиться за кожевником или тем, кто занимался обработкой коры для дубления кож.

Фамилия относится к типичной модели русских фамилий на -ин, указывающей на принадлежность: чей? — Кожурин, то есть сын или потомок Кожуры. Суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я, что отличает её от фамилий на -ов, образованных от основ на согласный. По структуре Кожурин стоит в одном ряду с фамилиями вроде Пузырин, Шелухин или Корочкин — все они восходят к прозвищам, связанным с внешностью или бытовыми предметами.

Географически фамилия встречается в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях, где слово «кожура» было в ходу и в прямом, и в переносном значении. В старых писцовых книгах XVI–XVII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с этим прозвищем, но конкретные даты и имена остаются за рамками широко известных источников.

Стоит отметить, что фамилия Кожурин не имеет отношения к слову «кожух» (тулуп или верхняя одежда), хотя по звучанию они близки. Кожухин — это отдельная фамилия с другим корнем. Различие в суффиксах как раз и помогает этимологам разделять эти линии: Кожурин восходит к основе на -а, а Кожухин — к основе на согласный «х».