Фамилия Козлукова — женская форма фамилии Козлуков, а та, в свою очередь, образована от мирского имени или прозвища Козлук. В основе этого прозвища лежит слово «козел», но не в обиходном, а в древнем, дохристианском значении. В языческой традиции имя Козлук давали ребенку как оберег: считалось, что, назвав сына «козлом», родители делают его «своим» для природы, а значит, защищают от злых духов и передают ему жизненную силу и выносливость этого животного.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Козлуков вписана в типичный для русских фамилий ряд: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Козлука). Само прозвище Козлук образовано с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -ук (или -юк), который характерен для южных и западных регионов Руси (Украина, Белоруссия, южнорусские области). Это сразу выделяет фамилию из ряда однокоренных: если Козлов — повсеместная фамилия, то Козлуков имеет более узкую географическую привязку. Носители такой фамилии, скорее всего, происходят из районов, где были распространены формы на -ук/-юк.

Версия о том, что прозвище могло быть связано не с животным, а с ремеслом или поведением человека, менее правдоподобна. «Козлуком» в некоторых говорах называли упрямца или шалуна, но именно зооморфная основа (козел как тотемное животное) дает более глубокое и исторически обоснованное объяснение. Таким образом, Козлуковы — это потомки человека по прозвищу Козлук, жившего, вероятно, на юге или юго-западе России. Фамилия редкая, и в этом её особенность: она сохранила не только корень, но и региональную модель именования, почти стертую более массовыми фамилиями.