Фамилия Козляковец — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает прозвищное. В русских фамилиях суффикс -ец чаще всего указывает на выходца из определённого места: «откуда человек» (ср. Тамбовец, Ростовец). Поэтому логичнее всего видеть в основе топоним Козляково или Козляковка. Такие названия разбросаны по России и Украине — от Смоленской до Харьковской области. Человек, переселившийся из деревни Козляково, получал прозвище Козляковец, а закрепившаяся фамилия уже не менялась.

Но стоит разобрать и саму основу — Козляк. В славянской ономастике это могло быть прозвище от слова «козёл». Не обязательно с обидным оттенком: козла держали ради молока и шерсти, а прозвище мог получить пастух, упрямый или бородатый человек. Однако суффикс -як (как в Гуляк, Добряк) часто образовывал названия людей по характерному признаку или занятию. То есть Козляк — это «тот, кто связан с козлами»: пастух, торговец, даже человек с козлиной бородкой. А Козляковец — уже «сын Козляка» или «человек от Козляка». Но версия с топонимом убедительнее: фамилии на -ец в чистом виде (без патронимического суффикса -ов) почти всегда привязаны к месту.

Модель образования редкая. В русском языке фамилии на -ец встречаются, но не массово: чаще у украинцев и белорусов (Киянец, Житомирец). В русской традиции преобладают -ов/-ев и -ин. Козляковец — пример того, что фамилия могла остаться в форме прозвища, не переоформленного в стандартный патроним. Это говорит либо о позднем закреплении фамилии (в XIX веке), либо о том, что носители долго жили компактно и не смешивались с соседями, которые «исправляли» бы фамилию на Козляков.

Связь с животным не делает фамилию «простой» или «крестьянской» — козлы были в хозяйстве у всех сословий. Но суффикс -ец выдаёт человека, который был «пришлым» в своей местности. Предки Козляковец, скорее всего, переселились из одного села в другое и получили фамилию по покинутому месту. Если искать однокоренные фамилии, то Козляков — самая частая, Козляткин — редкая, а Козляковец стоит особняком именно из-за своей топонимической прозрачности.