Фамилия Козусев — это русская фамилия, образованная по стандартной патронимической модели: к основе прозвища Козусь добавили типичный русский суффикс принадлежности -ев. Суффикс указывает на то, что перед нами «сын (или потомок) Козуся». Само прозвище Козусь — явление нечастое, и его происхождение неоднозначно, поэтому у фамилии есть несколько версий.

Самая убедительная версия связывает Козуся с украинским диалектным словом «козусь», которое означало «кожух» — тулуп из овчины. В таком случае прозвище носило профессиональный характер: Козусем называли кожухаря, то есть портного, который шил овчинные тулупы. Это объяснение логично и вписывается в распространённую модель, когда ремесленника называли по предмету его труда.

Другая версия отсылает к тюркскому корню, а именно к киргизскому слову «козут» — «подбивать, подговаривать, подстрекать». Если основа действительно тюркская, то прозвище Козусь характеризовало человека по поведению — задиристого, склонного к подстрекательству. Эта версия менее вероятна, так как фамилия Козусев не типична для регионов с сильным тюркским влиянием, а её ареал скорее связан с южнорусскими и украинскими землями.

Существует и третья, совсем маловероятная гипотеза, которая возводит прозвище к польскому слову kożuszek — «пенка». Согласно ей, Козусем могли прозвать любителя молочных пенок. Эта версия выглядит натянутой: называть человека по такому бытовому признаку — редкость, и слово «козусь» в значении «пенка» практически не фиксируется в восточнославянских говорах.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что предок носителя фамилии Козусев был скорняком или портным, шившим овчинные тулупы. Фамилия эта редкая, и её анализ показывает, как в одном прозвище могли переплестись украинские диалектные, а возможно, и тюркские языковые следы.