Фамилия Козусева — женская форма фамилии Козусев. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Козусь. Словообразовательная модель здесь не самая частая: суффикс -ев присоединён к основе, оканчивающейся на мягкий согласный (Козус-), что характерно для фамилий, образованных от прозвищ с уменьшительными или пренебрежительными суффиксами. Сама основа Козус- прозрачно связана с «козой» — либо с домашним животным, либо с переносным значением: в русских говорах «козой» называли бойкую, вертлявую или капризную девушку, а «козусей» — человека с каким-то особенным, возможно, упрямым или прыгучим нравом.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «козуля» (соха, орудие пахоты) или «козуля» (олень, косуля). В таком случае Козусь могло быть прозвищем пахаря или охотника. Однако форма на -усь (как Бормус, Гудусь) скорее указывает на уменьшительно-ласкательное или ироничное образование от животного, а не от орудия труда.

Фамилия редкая. По данным открытых источников, Козусевы встречаются в основном на юге России — в Ростовской области и Краснодарском крае, а также в Запорожье. Это косвенно подтверждает украинский или южнорусский след: в украинском языке слово «коза» и его производные («козуся», «козусь») бытуют как ласковые обращения или прозвища.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Козулин, Козуля, Козуев) показывает, что Козусев стоит особняком: суффикс -усь в русской антропонимии XVII–XVIII веков встречается реже, чем -ул(я) или -ух(а). Это говорит о том, что прозвище Козусь могли дать в среде, где были сильны польские или белорусские влияния (в этих языках суффикс -усь часто образует ласкательные формы). Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, жил на пограничье русских и украинских земель и получил прозвище за сходство с козой — по поведению или внешности.