Фамилия Крапалина — женская форма фамилии Крапалин, и её происхождение, скорее всего, связано с профессиональным прозвищем. В основе лежит слово «крапаль» или «крапала», которое в русских говорах означало мастера, наносящего крапинки, узор в виде точек. Чаще всего так называли маляра, который занимался «под крапинку» — имитацией ценных пород дерева или камня под мрамор. В среде иконописцев, ремесленников и даже портных (кто ставил метки краской) такое прозвище было конкретным и понятным.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Крапалин — это «сын Крапалы» или «человек из семьи Крапалы». Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Крапа́лин, хотя в некоторых регионах могли говорить и Крапали́н — это не меняет сути.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «крапать» (моросить, капать редко). В этом случае прозвище Крапала могли дать человеку медлительному или тому, кто «капал на нервы» мелкими придирками. Однако первая версия — ремесленная — выглядит убедительнее, потому что такие прозвища чаще закреплялись за конкретным занятием.

Фамилия не является массовой и распространена преимущественно в центральных и северных областях России, где были развиты промыслы по росписи и отделке дерева. Встречается также вариант Крапалёв, образованный с другим суффиксом, что указывает на ту же основу, но иную диалектную или патронимическую традицию. Носительница фамилии Крапалина может с высокой долей вероятности считать своим предком не крестьянина-землепашца, а ремесленника, мастера по декоративной отделке, что было занятием уважаемым и довольно специализированным.