Фамилия Крестиненко — характерный пример украинской фамилии, образованной по патронимической модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, буквально означает «маленький» или «сын», то есть Крестиненко — это «сын Крестины». В основе фамилии лежит женское имя Крестина, которое в русской традиции чаще встречается в форме Кристина. Само имя восходит к латинскому Christianus — «христианин», «посвящённый Христу».

Стоит отметить, что фамилии на -енко в XVII–XIX веках массово фиксировались на землях Левобережной и Слободской Украины, а также в южнорусских областях, куда активно переселялись украинские крестьяне и казаки. Поэтому географически Крестиненко — фамилия преимущественно украинская, хотя встречается и в смешанных пограничных регионах, например, в Курской и Воронежской губерниях. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных форм крестильных имён, украинская модель -енко чаще использовала разговорные или уменьшительные варианты имени матери или отца. В данном случае форма «Крестина» — это народный, упрощённый вариант канонического имени Христина, который бытовал в среде простых людей.

Словообразовательная цепочка прозрачна: Крестина → Крестиненко. Интересно, что фамилия не содержит дополнительных прозвищных или профессиональных корней — она чисто именная, что говорит о том, что родоначальника, скорее всего, звали просто по имени матери или отца. В украинской традиции фамилии от женских имён встречаются реже, чем от мужских, но они есть: например, Марченко (от Марья или Марфа), Настенко (от Анастасия). Крестиненко стоит в этом же ряду.

Если говорить о возможном социальном происхождении, то носители фамилии были, как правило, крестьянами или казаками. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано — это фамилия непривилегированных сословий. В современных базах данных фамилия встречается нечасто, что подтверждает её локальный характер: она могла возникнуть в одном или нескольких сёлах и распространиться с миграцией отдельных семей.